Comarch ERP XL 2013.1 zyskał zupełnie nowy moduł wspierający procesy związane z rejestrowaniem zawieranych przez firmę umów. Narzędzie pozwala zarejestrować dowolnego typu umowę, a także zdefiniować dla niej dodatkowe, własne elementy i właściwości. System wspiera również ocenę rentowności umów, która odbywa się na podstawie dokumentów powiązanych z daną umową. Mogą to być dowolne dokumenty lub pozycje dokumentów zarejestrowanych w systemie Comarch ERP XL.
Kolejna grupa nowości dotyczy obszaru magazynu wysokiego składowania (WMS – Warehouse Management System). W Comarch ERP XL 2013.1 zostały dodane nowe dokumenty WMS – awizo dostawy oraz zlecenie wydania z magazynu. Dzięki temu pracownicy magazynowi zyskają wzbogacone narzędzie do obsługi dostaw i wysyłek.
Istotną zmianą wprowadzoną w obszarze środków trwałych jest możliwość obsługi tzw. leasingu walutowego, w którym czynsze (opłaty) miesięczne, czynsz inicjalny (opłata wstępna) i cena sprzedaży (wartość wykupu) wyrażone są w walucie obcej, a także raty leasingowe są płatne w walucie obcej. Obszar księgowy wzbogacono m.in. o możliwość generowania harmonogramów dla księgowań okresowych. Umożliwiono także dodawanie opisu analitycznego bezpośrednio z poziomu dokumentów znajdujących się w obiegu.
Spośród licznych zmian w obszarze analityczno-raportowym Business Intelligence ciekawą funkcjonalnością jest możliwość wykorzystania SMS w ramach automatycznego przesyłania danych raportowych do określonych subskrybentów. W nowej wersji aplikacja działa również w trybie 64-bitowym, dzięki czemu może w pełni wykorzystać zasoby systemowe.
Równolegle z trzonem systemu rozwijane są narzędzia współpracujące, rozszerzające standardowe możliwości ERP. Na początku stycznia 2012 roku udostępniono nową wersję rozwiązania Comarch ERP Mobilny Sprzedawca na Android, wzbogaconą m.in. o możliwość obsługi sprzedaży typu vanselling. Wraz z Comarch ERP XL 2013.1 pojawiła się także nowa wersja aplikacji Comarch ERP Mobilny Magazynier.
W 2012 roku system Comarch ERP XL wybrało 365 nowych klientów. Tym samym łączna liczba firm korzystających z rozwiązania osiągnęła 4000.